Bedenken hat eine ähnliche Bedeutung wie Einwand. Beide richten sich darauf, dass ein erwünschtes Ergebnis weniger wahrscheinlich sein könnte als angenommen. Der Einwand zeigt objektiv an, dass ein Argument vorgebracht wird, Bedenken geben der Äußerung zusätzlich eine subjektive Färbung. Der negative Charakter der Einschränkung muss entweder durch eine Verneinung oder durch einen Inhalt, der im Kontext verneinend ist, bestätigt werden:
Ich habe Bedenken, dass es nicht funktionieren könnte. Ich habe Bedenken, dass es zusammenbrechen könnte.
Seine Bedenken, das Auto könnte durch diese Fahrweise kaputt werden, erwiesen sich als grundlos.
Sein Einwand, dass dieser Wagen für eine solche Last nicht zugelassen sei, wurde ignoriert.
Sie wandte ein, dass für den Wandertag schlechtes Wetter vorhergesagt sei.
"Bedenken, dass es funktioniert", kann daher nur der Saboteur haben, der eigentlich wünscht, dass es nicht funktioniert.