»Jan« is a male first name. So the personal pronoun referring to Jan must be male too. So it has to be:
sentence given: Jan möchte im Kurs deutsche Texte lernen. Er liebt deutsche Literatur.
- Jan möchte im Kurs deutsche Texte lernen. Er liebt nämlich deutsche Literatur.
- Jan möchte im Kurs deutsche Texte lernen, er liebt nämlich deutsche Literatur.
The answer to the question, if you can join two main sentences together with a comma resulting in one sentence, has nothing to do with the usage of certain words. So it is irrelevant, if there is a »nämlich« or not. And in this case there is no difference between English and German grammar:
Mein Auto ist alt. Es ist rostig.
My car is old. It is rusty.
Mein Auto ist alt, es ist rostig.
My car is old, it is rusty.
When you use »nämlich«, then you use it to tell a reason for something:
Mein Auto ist rostig. Es ist alt.
My car is rusty. It is old.
Mein Auto ist rostig. Es ist nämlich alt.
My car is rusty. The reason is: It is old.