Laut dem Zweifelsfall-Duden1 hat die Stellung damit zu tun, ob doch als Adverb oder als Konjunktion gebraucht wird. Beim Beispielsatz
Es war eigentlich gar nicht so schlimm.
ist beides möglich.
Doch als Adverb
Ich zitiere: "Wenn doch oder jedoch als Adverbien allein vor dem finiten Verb an der Spitze eines nebengeordneten Satzes stehen, führt das zu einer Stellung des Subjektes nach dem finiten Verb [...]".
Bei adverbialem Gebrauch von doch muss es demnach heißen:
Doch war es eigentlich gar nicht so schlimm.
Doch als Konjunktion
Ich zitiere: "Stehen doch oder jedoch nicht allein vor dem finiten Verb, dann fungieren sie als Konjunktionen." Und weiter: "[W]enn sie Hauptsätze miteinander verbinden [...], tritt doch immer an den Anfang des Satzes."
Gehen wir einmal davon aus, dass vor dem Beispielsatz noch ein anderer Satz steht. Dann fungiert doch im folgenden Satz als Konjunktion:
Doch es war eigentlich gar nicht so schlimm.
1 Eintrag doch / jedoch im Duden 9: Das Wörterbuch der sprachlichen Zweifelsfälle. 8. Auflage