When speaking, you can stress "von" and "mit" (and add a little break after "von"), so people will understand. Written down, it's a little hard to grasp (but still correct). 

Even after adding a comma the sentence remains bumpy:

> ...bei der die einfache Verknüpfung von, und die Interaktion mit Entitäten gewährleistet ist.

Maybe:

> ...bei der sowohl die einfache Verknüpfung von Entitäten, als auch die Interaktion mit ihnen gewährleistet ist.


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                                                                      Alternatives 

Turn it around:
> ...bei der sowohl die Interaktion mit Entitäten, als auch die einfache Verknüpfung dieser gewährleistet ist.

Allow repetition:
>...bei der die einfache Verknüpfung von Entitäten und auch die Interaktion mit Entitäten gewährleistet ist.