There is a misconception here.
- Wan wird das funktionieren?
- Um wie viel Uhr wirst du kommen?
In these setences, the ending -en is not that of the plural but of the infinitive forms of the verbs funktionieren and kommen. In other words, they are not conjugated. This is so because there is the auxiliary verb werden, and in German the auxiliary verb is conjugated. The conjugation forms depend on person (ich, du er/ sie/ es, wir, ihr sie), for example:
- es wird funktionieren
- du wirst kommen
... - wir werden funktionieren
- ihr werdet kommen