As Jitter already mentioned, *Zeiterfassung* is the standard term for tracking time, for example when tracking working hours.

> Sie sind zur Arbeitszeiterfassung verpflichtet.

*Zeitverfolgung* is not typically used. To me, it sounds like following time, having a dog follow time’s trails. This is in line with the second meaning of the verb *to track* which is generally not intended when referring to *time tracking*. However, you could also understand it as *following the passage of time*.

> »Da vorne läuft die Zeit! Hinterher!« »Welche eine Zeitverfolgung.«
>
> (Am Telefon) »Ich sitze auf dem Sofa und verfolge, wie die Zeit vergeht.« »Na hast du denn außer Zeitverfolgung heute noch etwas anderes vor?«

(Examples not exactly everyday usage — naturally.)