Wie du schon erkannt hast, ist "Hast du sie noch alle?" eine Redewendung und "sie" hat daher nicht wirklich eine Bedeutung. Ich würde "Hast du noch alle Tassen im Schrank?" als Herkunft sehen, das "sie" würde sich dann auf "die Tassen" beziehen, welche wiederum für die Gedanken der angesprochenen Person stehen, im Sinne von "Hast du deine Gedanken noch alle beisammen?".

Wie du schon erkannt hast, ist „Hast du sie noch alle?“ eine Redewendung und sie hat daher nicht wirklich eine Bedeutung. Ich würde „Hast du noch alle Tassen im Schrank?“ als Herkunft sehen, das sie würde sich dann auf die Tassen beziehen, welche wiederum für die Gedanken der angesprochenen Person stehen, im Sinne von „Hast du deine Gedanken noch alle beisammen?“