When speaking, you can stress "von" and "mit" (and add a little break after "von"), so people will understand. Written down, it's a little hard to grasp.
Even after adding a comma the sentence remains bumpy:
...bei der die einfache Verknüpfung von, und die Interaktion mit Entitäten gewährleistet ist.
Maybe:
.. bei der sowohl die einfache Verknüpfung von Entitäten, als auch die Interaktion mit ihnen gewährleistet ist.