When speaking, you can stress "von" and "mit" (and add a little break after "von"), so people will understand. Written down, it's a little hard to grasp.

Even after adding a comma the sentence remains bumpy:

...bei der die einfache Verknüpfung von, und die Interaktion mit Entitäten gewährleistet ist.

Maybe:

.. bei der sowohl die einfache Verknüpfung von Entitäten, als auch die Interaktion mit ihnen gewährleistet ist.

When speaking, you can stress "von" and "mit" (and add a little break after "von"), so people will understand. Written down, it's a little hard to grasp (but still correct).

Even after adding a comma the sentence remains bumpy:

...bei der die einfache Verknüpfung von, und die Interaktion mit Entitäten gewährleistet ist.

Maybe:

...bei der sowohl die einfache Verknüpfung von Entitäten, als auch die Interaktion mit ihnen gewährleistet ist.

                                                                       Alternatives

Turn it around:

...bei der sowohl die Interaktion mit Entitäten, als auch die einfache Verknüpfung dieser gewährleistet ist.

Allow repetition:

...bei der die einfache Verknüpfung von Entitäten und auch die Interaktion mit Entitäten gewährleistet ist.