In German a Box is a widely accepted loanword from English where we have no doubt about the plural form Boxen.
Therfore a composite word follows the same rules. In the given example this would be:
Die Timeboxen
This would even work with brand-new made-up words (Rekiboxen).
Die Box ist ein mittlerweile gut eingedeutschtes Lehnwort aus dem Englischen, bei der über den Plural Boxen kein Zweifel besteht.
Analog muss man auch Komposita behandeln, somit wäre der Plural im kronkreten Fall:
Die Timeboxen
Das würde auch mit neuen Phantasiewörtern funktionieren (Rekiboxen).